Одно из новых и перспективных направлений в развитии туризма в регионе.Десятая часть всей площади округа - около 8 миллионов гектаров - является особо охраняемой природной территорией. Особо охраняемая природная территория- территория (акватория), имеющая особое значение для сохранения или восстановления природных комплексов или их компонентов и поддержания экологического баланса. В округе действует 11 особо охраняемых природных территорий регионального значения:
1. Природный парк «Полярно-Уральский»;
2. Государственный природный заказник «Верхнеполуйский»;
3. Государственный природный заказник «Полуйский»;
4. Государственный природный заказник «Собты-Юганский»;
5. Государственный биологический (ботанический и зоологический) заказник «Ямальский»;
6. Государственный природный заказник «Пякольский»;
7. Государственный природный заказник «Мессо-Яхинский»;
8. Государственный природный заказник регионального значения «Сынско-Войкарский»;
9. Государственный природный заказник регионального значения «Нижне-Обский»;
10. Государственный природный заказник регионального значения «Куноватский»;
11. Государственный природный заказник регионального значения «Надымский».
На территории региона обитают 60 видов млекопитающих, 224 вида птиц, 2 вида рептилий и 5 видов амфибий – всего 310 видов. Одним из уникальных представителей млекопитающих является овцебык – последний представитель так называемой мамонтовой фауны. На данный момент на территории природного парка «Полярно-Уральский» обитает около 140 особей овцебыка. На сегодняшний день созданный питомник овцебыков является уникальнейшим не только на территории Российской Федерации, но и во всем мире.